基于RNA和单细胞测序数据挖掘鉴定与心肌炎相关的关键转座因子

发布时间：2024-06-18 16:26:27 栏目：精选知识

导读 转座因子 (TE) 在历史上被视为基因组寄生虫，现在已确认是细胞身份和功能的重要贡献者，尤其是在免疫调节方面。哺乳动物基因组含有大量

转座因子 (TE) 在历史上被视为基因组寄生虫，现在已确认是细胞身份和功能的重要贡献者，尤其是在免疫调节方面。



哺乳动物基因组含有大量 TE。这些元素的多样性和丰富性影响着基因组的结构、功能和进化。它们通过改变转录因子结合位点和产生新的增强子活性来影响基因调控网络。越来越多的证据表明 TE 在各种疾病中起着至关重要的作用，尤其是在调节免疫力方面。然而，在心肌炎的背景下，人们对 TE 的影响关注不足，这凸显了一个潜在的研究领域，可以为驱动这种心脏疾病的分子机制提供新的见解。

在科爱期刊《繁殖与育种》上发表的一项研究中，湖南师范大学的一组研究人员利用 RNA-Seq 和单细胞 RNA-Seq 数据来识别与心肌炎相关的关键 TE。

该团队利用公开数据库探索 TE 在心肌炎中的作用。分析了 RNA 测序数据和单细胞测序数据，重点研究了实验性自身免疫性心肌炎 (EAM) 的小鼠模型。RNA 测序分析显示心脏组织中一系列免疫基因显著上调。

“我们利用心脏免疫细胞的单细胞测序进一步研究，确定了某些转座因子 (TE) 在心脏不同类型免疫细胞中的特异性表达，”该研究的第一作者陈思星说道。“我们观察到 ERVB7-1 的表达总体增加。”

EAM 模型中跨各种细胞的 LTR-MM 转座子表明该转座子对该疾病背景下的免疫反应具有广泛的影响。

陈补充道：“我们的研究结果强调了心肌病中 TE 与免疫系统之间复杂的相互作用，为这种疾病背后的分子机制提供了新的见解。”

尤其是，在心脏免疫细胞中发现特定的 TE 表达，以及 EAM 模型中 ERVB7-1. LTR-MM 表达总体增加，强调了这些元素在调节免疫反应方面的潜力，并有助于我们了解心肌病的发病机制。这些观察结果为进一步研究 TE 在心脏疾病中的作用开辟了道路，优化了新的治疗策略。